Zpracování medicínských obrazů
Kód | Zakončení | Kredity | Rozsah | Jazyk výuky |
---|---|---|---|---|
BAM33ZMO | Z,ZK | 6 | 2P+2C | česky |
- Garant předmětu:
- Jan Kybic
- Přednášející:
- Jan Kybic
- Cvičící:
- Denis Baručić, Jan Kybic
- Předmět zajišťuje:
- katedra kybernetiky
- Anotace:
-
Předmět se zabývá nejčastěji používanými pokročilými metodami analýzy obrazu se zaměřením na obrazy z lékařských a biologických modalit, od mikroskopie, přes ultrazvuk, až po MRI a CT, včetně časových sekvencí.
- Požadavky:
-
Znalost programování, základní znalost technik zpracování obrazů, základní znalost principů lékařských zobrazovacích metod.
- Osnova přednášek:
-
1. Segmentace - metody aktivních kontur, levelsety
2. Statistické modely pro segmentaci
3. Segmentace na základě superpixelů a grafových modelů
4. Segmentace pomocí textury
5. Segmentace pomocí hlubokého učení
6. Detekce buněk a buněčných jader
7. Detekce cév a vláken
8. Detekce plicních nodulů a mamografie
9. Lokalizace orgánů a struktur
10. Registrace založená na bodech a kritériích podobnosti
11. Elastická registrace
12. Registrace pomocí hlubokého učení.
- Osnova cvičení:
-
Cvičení probíhají v počítačové laboratoři, kde si studenti prakticky vyzkouší některé probrané algoritmy. Některé
vybrané metody sami naprogramují, v ostatních případech se naučí používat existující volně dostupné knihovny a
toolboxy. Tímto způsobem získají studenti nejen základní přehled o existujících metodách, ale budou jim i hlouběji
rozumět a řadu z nich se naučí prakticky používat.
- Cíle studia:
-
Naučit se principům a použití základních algoritmů pro zpracování lékařských a biologických obrazů, zejména registrace, segmentace a klasifikace. Jednodušší algoritmy budou studenti sami implementovat.
- Studijní materiály:
-
1. Toennies: Guide to Medical Image Analysis, Springer 2012
2. Deserno: Biomedical Image Processing, Springer 2011
3. Yoo: Insight into images. Taylor & Francis, 2004
4. Birkfellner: Applied Medical Image Processing, CRC Press 2011
5. Jan: Medical Image Processing, Reconstruction and Restoration, CRC Press 2006
6. Dhawan: Medical Image Analysis, IEEE Press, 2003
7. Šonka, Fitzpatrick: Handbook of Medical Imaging: Volume 2, Medical Image Processing and Analysis, SPIE Press,
2000
- Poznámka:
- Další informace:
- https://cw.fel.cvut.cz/wiki/courses/zmo
- Rozvrh na zimní semestr 2023/2024:
-
06:00–08:0008:00–10:0010:00–12:0012:00–14:0014:00–16:0016:00–18:0018:00–20:0020:00–22:0022:00–24:00
Po Út St Čt Pá - Rozvrh na letní semestr 2023/2024:
- Rozvrh není připraven
- Předmět je součástí následujících studijních plánů:
-
- Lékařská elektronika a bioinformatika - Specializace Bioinformatika (povinně volitelný předmět)
- Lékařská elektronika a bioinformatika - Specializace Lékařská technika (povinně volitelný předmět)
- Lékařská elektronika a bioinformatika - Specializace Zpracování obrazu (PS)
- Lékařská elektronika a bioinformatika - Specializace Zpracování signálů (povinně volitelný předmět)
Předmět BAM33ZMO může při kontrole studijních plánů nahradit předmět A6M33ZMO
Podmínkou zápisu na předmět BAM33ZMO je, že student si nejpozději ve stejném semestru zapsal příslušný počet předmětů ze skupiny BEZBM