Biostatistika

Přednášející:

Vladimír Rogalewicz (gar.), Veronika Mezerová

Cvičící:

Vladimír Rogalewicz (gar.), Veronika Mezerová

Předmět zajišťuje:

katedra biomedicínské techniky

Anotace:

Statistika a zpracování biomedicínských dat. Využití statistiky pro manažerské rozhodování. Grafické znázornění dat. Náhodná veličina a její rozdělení. Senzitivita a specifita. Principy statistického uvažování. Testování hypotéz, hladina a síla testu. Výběr z normálního rozdělení a odhady parametrů. T-testy. Neparametrické testy - Wilcoxonovův, Kolmogorov-Smirnovův. Testování hypotéz v binomickém rozdělení. Porovnání několik výběrů - analýza rozptylu. Měření závisloti. Regresní analýza. Korelační analýza. Analýza kategoriálních dat. Testy dobré shody. Testy v kontingenčních tabulkách. Statistické metody v epidemiologii.

Požadavky:

Požadavky ke klasifikovanému zápočtu:

Klasifikovaný zápočet je zaměřen na zpracování dat sebraných z dotazníkového šetření v programu R, správnou interpretaci výsledků. Práce se bude týkat statistického vyhodnocení a bude obsahovat jak část popisné statistiky, tak induktivní statistiku (testování hypotéz). V této části budou popsány použité metody, ověřeny předpoklady těchto metod apod.

Téma práce je dáno vyučujícím. Práce bude obodována max. 100 body.

Zápočet bude udělen dle standardní klasifikační stupnice.

Osnova přednášek:

1.Úvod do statistické metodologie. Populace a výběr. Výběrová šetření. Statistika v biomedicínském výzkumu. Průběh výzkumného projektu. Druhy dat, grafické znázornění dat, míry polohy, míry variability.

2.Náhodná veličina, distribuční funkce, hustota, kvantily, střední hodnota, rozptyl. Normální a binomické rozdělení.

3.Základy statistického uvažování - výběrový průměr z N(?,σ2), bodový, intervalový odhad.Testování hypotéz, hladina testu. Jednovýběrový T-test. Jednovýběrový Wilcoxonův test, znaménkový test.

4.Dva výběry - dvouvýběrový t-test. Párový t-test. Relativní četnost. Porovnání populačních pravděpodobností. Dvouvýběrový Wilcoxonovův, Kolmogor-Smirnovův test.

5.Porovnání několika výběrů -ANOVA - jednoduché třídění. Kruskal-Wallisův test. Analýza kategoriálních dat - χ2 testy dobré shody. Kontingenční tabulky - χ2 test nezávislosti, McNemarův, Fischerův test.

6.Měření závislosti - regresní a korelační analýza - metoda nejmenších čtverců, regresní přímka, rezidua, výběrový korelační koeficient, Spearmanův kor. koef

7.Konzultace, opakování, rezerva

Přednášky probíhají souběžně s předmětem 17MSBST, zde budou také studijní materiály.

Osnova cvičení:

V rámci cvičení si studenti procvičí na modelových příkladech a datech. Metody pak budou ilustrovány i na medicínském tématu.

1.Metodologie výzkumu, tvorba dotazníku, výběry. Zadání semestrální práce.

2.Základní práce s datovým souborem, příprava datového souboru. Seznámení s programem R, popisné statistiky, grafické vyjádření dat - excel i R

3.Úprava proměnných, vytvoření nových proměnných, kategorizace dat, vztah kvalitativní a kvantitativní veličiny, grafy (děti)

4.Intervalové odhady, střední chyba průměru. Testování hypotéz - řešení příkladů na pochopení principů testování hypotéz, formulace hypotéz, závěry.

5.Testování hypotéz v R - Jednovýběrové testy, parametrické i neparametrické metody, dvouvýběrový x párový test, parametrické a neparametrické metody. Příklady a praktické použití

6.Analýza rozptylu jednoduchého třídění, korelace, regrese

7.Binomické rozdělení - test shody proporcí. Multinomické rozdělení - testy dobré shody, test reprezentativity výběru. testy v kontingenčních tabulkách. Fischerův test.

Cíle studia:

Cílem předmětu je seznámit studenty se základními pojmy statistiky a jejich aplikace v lékařství. Seznámení studentů se základními aplikacemi v biomedicínském výzkumu a epidemiologii. Vysvětlení a pochopení základních principů a metod statistické analýzy dat tak, aby posluchač jednodušší úlohy vyřešil sám a u složitějších byl schopen dobře komunikovat s odborníkem statistikem.

Studijní materiály:

-Zvára, K: Biostatistika. ISBN 978-80-246-0739-9, 2006

-Zvárová, J: Základy biostatistiky pro biomedicínské obory. ISBN 978-80-7184-786-1, 2007

-Zvárová J, Malý M: Statistické metody v epidemiologii, ISBN 80-246-0765-4, 2003

-Hendl, J: Přehled statistických metod zpracování dat, ISBN 80-7367-123-9, 2006

-Anděl, J: Statistické metody. ISBN 80-85863-27-8, 1998

Poznámka:

Rozvrh na zimní semestr 2011/2012:

	06:00–08:0008:00–10:0010:00–12:0012:00–14:0014:00–16:0016:00–18:0018:00–20:0020:00–22:0022:00–24:00
Po
Út	místnost KL:B-507 Rogalewicz V. Mezerová V. 16:00–17:50 LICHÝ TÝDEN (přednášková par. 2) Kladno FBMI Učebna místnost KL:A-10 Rogalewicz V. Mezerová V. 16:00–17:50 SUDÝ TÝDEN (přednášková par. 2) Kladno FBMI Lab. zobrazovacích systémů
St
Čt
Pá

Rozvrh na letní semestr 2011/2012:

Rozvrh není připraven

Předmět je součástí následujících studijních plánů:

• Navazující magisterský studijní obor Přístroje a metody pro biomedicínu - prezenční (povinně volitelný předmět)