Biostatistika

Přednášející:

Cvičící:

Předmět zajišťuje:

katedra biomedicínské techniky

Anotace:

Statistika a zpracování biomedicínských dat. Využití statistiky pro manažerské rozhodování. Grafické znázornění dat. Náhodná veličina a její rozdělení. Principy statistického uvažování. Testování hypotéz, hladina a síla testu. Výběr z normálního rozdělení a odhady parametrů. T-testy. Neparametrické testy - Wilcoxonovův, Kolmogorov-Smirnovův. Testování hypotéz v binomickém rozdělení. Porovnání několik výběrů - analýza rozptylu. Měření závislosti. Regresní analýza. Korelační analýza. Analýza kategoriálních dat. Testy dobré shody. Testy v kontingenčních tabulkách.

Požadavky:

Podmínky zápočtu:

1.Povinná účast na cvičení (10 povinných účastí). Student je povinen se na cvičení předem připravit, vypracovat zadané domácí úlohy; nesplnění této podmínky může vést k vyloučení studenta z daného cvičení a je považováno za neomluvenou absenci. 30 bodů (za každou další neúčast -3 body).

2.Semestrální práce zaměřená na navržení výzkumného projektu, zpracování dat sebraných z vytvořeného dotazníku, resp. pozorování. Práce bude obsahovat stručný úvod o zkoumané problematice, metodologickou část (stručné zdůvodnění volby metodiky výzkumu). Hlavní část se bude týkat statistického vyhodnocení a bude obsahovat jak část popisné statistiky, tak induktivní statistiku (testování hypotéz). V této části budou popsány použité metody, ověřeny předpoklady těchto metod apod. Současně s výslednou zprávou student odevzdá i zdrojová data ve formátu txt - text oddělený tabulátory.

Téma výzkumného projektu si student zvolí sám - bude ideálně v souladu s tématem diplomové práce, např. pilotní šetření. Dotazník bude obsahovat cca 15 otázek (identifikace respondenta + vlastní obsahová část). Rozsah výběru minimálně 50 respondentů (pozorování), způsob výběru dle tématu (bude zdůvodněno). Vybrané téma oznámí student svému cvičícímu ve třetím týdnu semestru. Práce bude obodována max. 70 body. Práce bude odevzdána nejpozději v zápočtovém týdnu.

3.Zápočet bude udělen za 70 bodů.

Požadavky ke zkoušce:

1.Splnění požadavků k zápočtu.

2.Písemný test

Zkouška bude písemná. V testu budou jak teoretické otázky, tak modelové příklady v rozsahu probrané látky.

Osnova přednášek:

1.Úvod do statistické metodologie. Populace a výběr. Výběrová šetření. Statistika v biomedicínském výzkumu. Průběh výzkumného projektu. Druhy dat, grafické znázornění dat, míry polohy, míry variability.

2.Náhodná veličina, distribuční funkce, hustota, kvantily, střední hodnota, rozptyl. Normální a binomické rozdělení.

3.Základy statistického uvažování - výběrový průměr z N(?,σ2), bodový, intervalový odhad.Testování hypotéz, hladina testu. Jednovýběrový T-test. Jednovýběrový Wilcoxonův test, znaménkový test.

4.Dva výběry - dvouvýběrový t-test. Párový t-test. Relativní četnost. Porovnání populačních pravděpodobností. Dvouvýběrový Wilcoxonovův, Kolmogor-Smirnovův test.

5.Porovnání několika výběrů -ANOVA - jednoduché třídění. Kruskal-Wallisův test. Analýza kategoriálních dat - χ2 testy dobré shody. Kontingenční tabulky - χ2 test nezávislosti, McNemarův, Fischerův test.

6.Měření závislosti - regresní a korelační analýza - metoda nejmenších čtverců, regresní přímka, rezidua, výběrový korelační koeficient, Spearmanův kor. koef

7.Konzultace, opakování, rezerva

Osnova cvičení:

V rámci cvičení si studenti procvičí na modelových příkladech a datech. Metody pak budou ilustrovány i na medicínském tématu.

1.Metodologie výzkumu, tvorba dotazníku, výběry. Zadání semestrální práce.

2.Základní práce s datovým souborem, příprava datového souboru. Seznámení s programem R, popisné statistiky, grafické vyjádření dat - excel i R

3.Popisné statistiky II - demografická data, odlehlá pozorování, grafické vyjádření korelace (soubor děti), studie - hladina hemoglobinu u žen

4.Úprava proměnných, vytvoření nových proměnných, kategorizace dat, vztah kvalitativní a kvantitativní veličiny, grafy (děti)

5.Souhrnná analýza dat o kojení. Souvislost kojení a věku matky, vzdělání/ Prezentace témat seminárních prací a dotazníků

6.Intervalové odhady, střední chyba průměru. Testování hypotéz - řešení příkladů na pochopení principů testování hypotéz, formulace hypotéz, závěry.

7.Testování hypotéz v R - Jednovýběrové testy, parametrické i neparametrické metody

8.Dvouvýběrový x párový test, parametrické a neparametrické metody. Příklady a praktické použití

9.Opakování, shrnutí probraných témat. Diskuse k seminárním pracem.

10.Analýza rozptylu jednoduchého třídění (data kojeni), koncentrace mědi v játrech štik, hladina IgA u dětí

11.Korelace, regrese (data kojení), souvislost porodní délky a hmotnosti, závislost výšky děvčat na jejich porodní délce, souvislost věku rodičů. Regrese - vztah IQ a známek ve škole.

12.Binomické rozdělení - test shody proporcí. Multinomické rozdělení - testy dobré shody, test reprezentativity výběru. χ2 testy v kontingenčních tabulkách. Fischerův test.

13.Konzultace k semestrální práci

14.Opakování, rezerva

Cíle studia:

Studijní materiály:

Zvárová, J: Základy biostatistiky pro biomedicínské obory. ISBN 978-80-7184-786-1, 2007 (http://new.euromise.org/czech/tajne/ucebnice/html/html/node1.html)

Zvára, K: Biostatistika. ISBN 978-80-246-0739-9, 2006

Kubánková V., Hendl J.: Statistika pro zdravotníky

Zvárová J, Malý M: Statistické metody v epidemiologii,

H. Swoboda: Moderní statistika, Svoboda 1977,

Anděl, J: Statistické metody. ISBN 80-85863-27-8, 1998

Poznámka:

Další informace:

Pro tento předmět se rozvrh nepřipravuje

Předmět je součástí následujících studijních plánů:

• Navazující magisterský studijní obor Systémová integrace procesů ve zdravotnictví - kombinované (povinný předmět)